Spēle ir izstrādāta kādā slepenā laboratorijā, kas atrodas apakšā okeānā. Šeit vientulībā dzīvoja ekscentrisku zinātnieku, pieredze un eksperimenti kolēģi vainot viņu. Viņa galvenais uzdevums bija izveidot dzīvas būtnes saprāts un gadus vēlāk viņš to darīja. Bet tajā pašā laikā autors pazudusi zem mīklainos apstākļos, atstājot Goo (šis vārds ir ieguvis pēcnācējus) un gaidīt, lai viņš garām. Hero noguris piekārtiem kolbā-kameru un izkļūt no tā, viņš devās ekskursijā komplekss atrast pēdas trūkstošo draugu. Iespēja izvēlēties pakāpi elastības palīdzēs pārvarēt dažādus šķēršļus, lai tiktu galā ar ienaidnieku, un iekļūt to, kur parasts cilvēks vai kā ne saņemt.